Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC12Q8WUD4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms