Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WHAMMQ8TF30 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WHAMMQ8TF30 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WHAMMQ8TF30 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WHAMMQ8TF30 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WHAMMQ8TF30 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WHAMMQ8TF30 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WHAMMQ8TF30 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
WHAMMQ8TF30 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WHAMMQ8TF30 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WHAMMQ8TF30 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WHAMMQ8TF30 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WHAMMQ8TF30 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WHAMMQ8TF30 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WHAMMQ8TF30 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms