Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTRT2Q8TDY3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT2Q8TDY3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms