Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD9Q8NBP5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD9Q8NBP5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD9Q8NBP5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms