Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PHTF2Q8N3S3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms