Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPC2Q8N158 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GPC2Q8N158 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
GPC2Q8N158 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GPC2Q8N158 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPC2Q8N158 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPC2Q8N158 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
GPC2Q8N158 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPC2Q8N158 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPC2Q8N158 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GPC2Q8N158 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GPC2Q8N158 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPC2Q8N158 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPC2Q8N158 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPC2Q8N158 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GPC2Q8N158 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPC2Q8N158 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GPC2Q8N158 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPC2Q8N158 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GPC2Q8N158 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GPC2Q8N158 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GPC2Q8N158 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GPC2Q8N158 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPC2Q8N158 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GPC2Q8N158 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPC2Q8N158 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GPC2Q8N158 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GPC2Q8N158 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GPC2Q8N158 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GPC2Q8N158 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GPC2Q8N158 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GPC2Q8N158 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPC2Q8N158 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GPC2Q8N158 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GPC2Q8N158 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms