Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID3BQ8IVW6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID3BQ8IVW6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms