Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LOXHD1Q8IVV2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LOXHD1Q8IVV2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LOXHD1Q8IVV2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms