Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC84Q86UT8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC84Q86UT8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms