Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDZD3Q86UT5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZD3Q86UT5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms