Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPGS1Q6ZTW0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPGS1Q6ZTW0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms