Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC129Q6ZRS4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC129Q6ZRS4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC129Q6ZRS4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms