Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP6Q6ZN66 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GBP6Q6ZN66 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP6Q6ZN66 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms