Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBR1LQ6UX01 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBR1LQ6UX01 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms