Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB35

MTHFD1L, Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1LQ6UB35 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTHFD1LQ6UB35 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD1LQ6UB35 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms