Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RGMBQ6NW40 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGMBQ6NW40 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGMBQ6NW40 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms