Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRAMD4Q6IC98 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRAMD4Q6IC98 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms