Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MCTP1Q6DN14 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCTP1Q6DN14 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP1Q6DN14 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms