Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPATA1Q5VX52 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA1Q5VX52 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms