Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM46CQ5VWP2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM46CQ5VWP2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms