Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf53Q5VUE5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C1orf53Q5VUE5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf53Q5VUE5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms