Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP100Q494V2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms