Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TWISTNBQ3B726 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TWISTNBQ3B726 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TWISTNBQ3B726 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms