Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBF2

WSCD2, WSC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD2Q2TBF2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
WSCD2Q2TBF2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WSCD2Q2TBF2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WSCD2Q2TBF2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD2Q2TBF2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD2Q2TBF2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD2Q2TBF2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD2Q2TBF2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD2Q2TBF2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD2Q2TBF2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WSCD2Q2TBF2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD2Q2TBF2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD2Q2TBF2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WSCD2Q2TBF2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms