Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRNQ16849 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRNQ16849 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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