Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms