Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF13Q15543 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF13Q15543 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms