Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP5Q14008 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CKAP5Q14008 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms