Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSTA3Q13630 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSTA3Q13630 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms