Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRQ13535 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRQ13535 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRQ13535 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRQ13535 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRQ13535 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRQ13535 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRQ13535 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRQ13535 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRQ13535 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRQ13535 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRQ13535 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRQ13535 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRQ13535 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRQ13535 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRQ13535 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRQ13535 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRQ13535 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRQ13535 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRQ13535 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRQ13535 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATRQ13535 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATRQ13535 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATRQ13535 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRQ13535 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRQ13535 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRQ13535 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRQ13535 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRQ13535 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRQ13535 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRQ13535 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRQ13535 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRQ13535 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRQ13535 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRQ13535 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRQ13535 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRQ13535 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRQ13535 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRQ13535 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRQ13535 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRQ13535 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRQ13535 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRQ13535 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRQ13535 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRQ13535 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRQ13535 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRQ13535 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRQ13535 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRQ13535 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRQ13535 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRQ13535 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRQ13535 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRQ13535 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRQ13535 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRQ13535 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRQ13535 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRQ13535 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRQ13535 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRQ13535 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRQ13535 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRQ13535 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRQ13535 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRQ13535 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
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