Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PICALMQ13492 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PICALMQ13492 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PICALMQ13492 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms