Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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