Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
FOXO1Q12778 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXO1Q12778 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms