Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 TRX2YGR209C 315 nt5.69□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 DBP8YHR169W 1296 nt5.69□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 PAU17YLL025W 375 nt5.69□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 YMR245WYMR245W 621 nt5.69□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 GSH2YOL049W 1476 nt5.69□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 EMP46YLR080W 1335 nt5.69□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 FAP1YNL023C 2898 nt5.69□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 YMR111CYMR111C 1389 nt5.68□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 LPL1YOR059C 1353 nt5.68□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 GAL4YPL248C 2646 nt5.68□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 DIT1YDR403W 1611 nt5.68□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 PML1YLR016C 615 nt5.68□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 RGT1YKL038W 3513 nt5.68□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 KCC4YCL024W 3114 nt5.68□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 FUM1YPL262W 1467 nt5.67□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 YGR291CYGR291C 222 nt5.67□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 NTR2YKR022C 969 nt5.67□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.67□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 AIF1YNR074C 1137 nt5.67□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.67□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 RPN5YDL147W 1338 nt5.67□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 BIT2YBR270C 1638 nt5.66□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 PEX19YDL065C 1029 nt5.66□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 HPM1YIL110W 1134 nt5.66□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.66□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 TLG2YOL018C 1194 nt5.66□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 ASF2YDL197C 1578 nt5.66□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 SMP1YBR182C 1359 nt5.66□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 ROT2YBR229C 2865 nt5.65□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 LEU1YGL009C 2340 nt5.65□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 MNN2YBR015C 1794 nt5.65□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 TIP20YGL145W 2106 nt5.65□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 RRP3YHR065C 1506 nt5.65□□□□□ -1.5
SNU66Q12420 PRM7YDL039C 2097 nt5.65□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 IXR1YKL032C 1794 nt5.65□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 MKS1YNL076W 1755 nt5.65□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 BUD22YMR014W 1560 nt5.64□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 SLC1YDL052C 912 nt5.64□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 CNL1YDR357C 369 nt5.64□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 YJL193WYJL193W 1209 nt5.64□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 RPT2YDL007W 1314 nt5.64□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 RRN3YKL125W 1884 nt5.64□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 UBA2YDR390C 1911 nt5.64□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 HES1YOR237W 1305 nt5.63□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 OMS1YDR316W 1416 nt5.63□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 TFG1YGR186W 2208 nt5.63□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 SIF2YBR103W 1608 nt5.63□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 GMC1YDR506C 1827 nt5.62□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 YDR417CYDR417C 372 nt5.62□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 UBC6YER100W 753 nt5.62□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 CAX4YGR036C 720 nt5.62□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 YIR043CYIR043C 693 nt5.62□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 YNL134CYNL134C 1131 nt5.62□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 snR3snR3 194 nt5.62□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 GIP2YER054C 1647 nt5.62□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 RSC6YCR052W 1452 nt5.61□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 LDB17YDL146W 1476 nt5.61□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 MRF1YGL143C 1242 nt5.61□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 FMP48YGR052W 1110 nt5.61□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 MSC7YHR039C 1935 nt5.61□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 MGS1YNL218W 1764 nt5.61□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 NRD1YNL251C 1728 nt5.61□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 TRS33YOR115C 807 nt5.61□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.61□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.61□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 VTC2YFL004W 2487 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 GCN20YFR009W 2259 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 YEH2YLR020C 1617 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 ALG2YGL065C 1512 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 HUL4YJR036C 2679 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 HIR2YOR038C 2628 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 TYW3YGL050W 822 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 NMA1YLR328W 1206 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 ECM33YBR078W 1290 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 ATG14YBR128C 1035 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 ECM32YER176W 3366 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 RAD30YDR419W 1899 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 EXO1YOR033C 2109 nt5.59□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 UBX7YBR273C 1311 nt5.59□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 YDL109CYDL109C 1944 nt5.59□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 MHF2YDL160C-A 243 nt5.59□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 SPR6YER115C 576 nt5.59□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 SAP30YMR263W 606 nt5.59□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 MAP2YBL091C 1266 nt5.59□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 YOL035CYOL035C 303 nt5.59□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 TIP41YPR040W 1071 nt5.59□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 QCR2YPR191W 1107 nt5.59□□□□□ -1.51
SNU66Q12420 FRE1YLR214W 2061 nt5.59□□□□□ -1.52
SNU66Q12420 MAG2YLR427W 2013 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU66Q12420 ARG4YHR018C 1392 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU66Q12420 LUC7YDL087C 786 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU66Q12420 GCV1YDR019C 1203 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU66Q12420 RPL28YGL103W 450 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU66Q12420 YGR153WYGR153W 654 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU66Q12420 RPC19YNL113W 429 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU66Q12420 PEP4YPL154C 1218 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU66Q12420 DBF4YDR052C 2115 nt5.57□□□□□ -1.52
SNU66Q12420 YGR011WYGR011W 327 nt5.57□□□□□ -1.52
SNU66Q12420 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.9 ms