Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 EFB1YAL003W 621 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 SSY5YJL156C 2100 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 CSR1YLR380W 1227 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 YLR407WYLR407W 687 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 ATG22YCL038C 1587 nt6.57□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 FLO8YER109C 2400 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 EFT2YDR385W 2529 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 EFT1YOR133W 2529 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 YEL067CYEL067C 588 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 FLD1YLR404W 858 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 RAD28YDR030C 1521 nt6.56□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 VAN1YML115C 1608 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 CAB3YKL088W 1716 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 PDR10YOR328W 4695 nt6.55□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 PWP1YLR196W 1731 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 YIL001WYIL001W 1542 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 RFA2YNL312W 822 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 SWC3YAL011W 1878 nt6.54□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 ACS1YAL054C 2142 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 IMD2YHR216W 1572 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 FAR10YLR238W 1437 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 RML2YEL050C 1182 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 BAT2YJR148W 1131 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 RPL18BYNL301C 561 nt6.53□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 HES1YOR237W 1305 nt6.52□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 YHR182WYHR182W 2358 nt6.52□□□□□ -1.36
TY1B-BRQ12193 ATF1YOR377W 1578 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 MAL11YGR289C 1851 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 GTT2YLL060C 702 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 VPS68YOL129W 555 nt6.52□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 HIS4YCL030C 2400 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 NUP42YDR192C 1293 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt6.51□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 YGL214WYGL214W 486 nt6.5□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt6.5□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 CDC28YBR160W 897 nt6.5□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 IMP1YMR150C 573 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 UBX2YML013W 1755 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 RAD16YBR114W 2373 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 RMD9YGL107C 1941 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 YTA12YMR089C 2478 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 YDR193WYDR193W 399 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 SGN1YIR001C 753 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 ILV5YLR355C 1188 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 YBR219CYBR219C 384 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 POP1YNL221C 2628 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 VAS1YGR094W 3315 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 AAD4YDL243C 990 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 YDR090CYDR090C 933 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 RPL28YGL103W 450 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 LOH1YJL038C 660 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 HXT2YMR011W 1626 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 CEX1YOR112W 2286 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 SLX1YBR228W 915 nt6.46□□□□□ -1.37
TY1B-BRQ12193 MSW1YDR268W 1140 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 SDS3YIL084C 984 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YIL152WYIL152W 708 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 PGM2YMR105C 1710 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 FBP1YLR377C 1047 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 VTC2YFL004W 2487 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 MTH1YDR277C 1302 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YLR446WYLR446W 1302 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 NMD5YJR132W 3147 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 HSP30YCR021C 999 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YJR038CYJR038C 363 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 ABZ1YNR033W 2364 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 CCZ1YBR131W 2115 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YGL072CYGL072C 360 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YML031C-AYML031C-A 336 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 EOS1YNL080C 1101 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YBR053CYBR053C 1077 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 ZRT1YGL255W 1131 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 MGS1YNL218W 1764 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 MET17YLR303W 1335 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 PDR18YNR070W 4002 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 TAF5YBR198C 2397 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 SLA1YBL007C 3735 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YDC1YPL087W 954 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 CYC8YBR112C 2901 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 RAD4YER162C 2265 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 CYM1YDR430C 2970 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YER190C-BYER190C-B 483 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YFL068WYFL068W 483 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 NAT2YGR147C 867 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1B-BRQ12193 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt6.4□□□□□ -1.38
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