Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSC1Q08554 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSC1Q08554 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSC1Q08554 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms