Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
GOLGA3Q08378 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
GOLGA3Q08378 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
GOLGA3Q08378 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
GOLGA3Q08378 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GOLGA3Q08378 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GOLGA3Q08378 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GOLGA3Q08378 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GOLGA3Q08378 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GOLGA3Q08378 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GOLGA3Q08378 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
GOLGA3Q08378 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GOLGA3Q08378 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
GOLGA3Q08378 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GOLGA3Q08378 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
GOLGA3Q08378 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms