Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK18Q07002 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK18Q07002 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK18Q07002 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms