Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCZQ05513 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKCZQ05513 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCZQ05513 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms