Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 MCM4YPR019W 2802 nt5.77□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SEC39YLR440C 2130 nt5.77□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 ERG1YGR175C 1491 nt5.77□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 APM3YBR288C 1452 nt5.77□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SIR1YKR101W 1965 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 ATH1YPR026W 3636 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 STB3YDR169C 1542 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YDL186WYDL186W 834 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 MTQ2YDR140W 666 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SDT1YGL224C 843 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 MPC2YHR162W 390 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YKR032WYKR032W 315 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SPC2YML055W 537 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YBR013CYBR013C 390 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YPL068CYPL068C 882 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SPO19YPL130W 672 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YME1YPR024W 2244 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SES1YDR023W 1389 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 CLA4YNL298W 2529 nt5.76□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 ARN1YHL040C 1884 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 DOT1YDR440W 1749 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 CCT8YJL008C 1707 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YDR029WYDR029W 315 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 RPB7YDR404C 516 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 HAP2YGL237C 798 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 MRPS35YGR165W 1038 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 EGD2YHR193C 525 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 NTR2YKR022C 969 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 PAU17YLL025W 375 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 RPS0BYLR048W 759 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YLR156WYLR156W 345 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YLR159WYLR159W 345 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YLR161WYLR161W 345 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YBL094CYBL094C 333 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 CEG1YGL130W 1380 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YNL095CYNL095C 1929 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 COX10YPL172C 1389 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 MCX1YBR227C 1563 nt5.75□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 VHS2YIL135C 1311 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SRO9YCL037C 1305 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YPR196WYPR196W 1413 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 TCM62YBR044C 1719 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SDA1YGR245C 2304 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YDR415CYDR415C 1125 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YGL177WYGL177W 348 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 CIS3YJL158C 684 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YJR085CYJR085C 318 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 TTI2YJR136C 1266 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 TOS6YNL300W 309 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 MCT1YOR221C 1083 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 RPB8YOR224C 441 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YPR153WYPR153W 423 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 RPL21AYBR191W 483 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 MED8YBR193C 672 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 FUM1YPL262W 1467 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 ALG9YNL219C 1668 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 MAL11YGR289C 1851 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 HAS1YMR290C 1518 nt5.74□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YHR020WYHR020W 2067 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 RIM101YHL027W 1878 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SAP155YFR040W 3009 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 PXA1YPL147W 2613 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 UBC1YDR177W 648 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YJR071WYJR071W 369 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YNL171CYNL171C 369 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 IZH4YOL101C 939 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 ARO4YBR249C 1113 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 POP4YBR257W 840 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 THI22YPR121W 1719 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 ATE1YGL017W 1512 nt5.73□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 IMA1YGR287C 1770 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 ADY3YDL239C 2373 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 NUF2YOL069W 1356 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SSU1YPL092W 1377 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 MBP1YDL056W 2502 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YDL119CYDL119C 924 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SYF2YGR129W 648 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 PCT1YGR202C 1275 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YHL018WYHL018W 363 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 SNL1YIL016W 480 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt5.72□□□□□ -1.49
SRP1Q02821 RPB4YJL140W 666 nt5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms