Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BNC1Q01954 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms