Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC42EP1Q00587 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDC42EP1Q00587 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms