Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFAMQ00059 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms