Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VLDLRP98155 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VLDLRP98155 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VLDLRP98155 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms