Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF7P61962 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCAF7P61962 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCAF7P61962 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DCAF7P61962 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms