Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FCGRTP55899 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FCGRTP55899 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms