Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3BP55884 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms