Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AFDNP55196 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AFDNP55196 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AFDNP55196 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AFDNP55196 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AFDNP55196 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AFDNP55196 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AFDNP55196 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AFDNP55196 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AFDNP55196 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AFDNP55196 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AFDNP55196 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AFDNP55196 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AFDNP55196 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AFDNP55196 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AFDNP55196 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AFDNP55196 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AFDNP55196 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AFDNP55196 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
AFDNP55196 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AFDNP55196 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AFDNP55196 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AFDNP55196 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AFDNP55196 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AFDNP55196 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AFDNP55196 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AFDNP55196 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
AFDNP55196 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AFDNP55196 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AFDNP55196 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AFDNP55196 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AFDNP55196 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AFDNP55196 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AFDNP55196 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AFDNP55196 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AFDNP55196 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AFDNP55196 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AFDNP55196 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AFDNP55196 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AFDNP55196 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AFDNP55196 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AFDNP55196 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AFDNP55196 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
AFDNP55196 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
AFDNP55196 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFDNP55196 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFDNP55196 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFDNP55196 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
AFDNP55196 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AFDNP55196 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AFDNP55196 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
AFDNP55196 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AFDNP55196 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
AFDNP55196 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
AFDNP55196 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29■■■□□ 2.23
AFDNP55196 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AFDNP55196 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
AFDNP55196 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AFDNP55196 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AFDNP55196 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
AFDNP55196 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AFDNP55196 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFDNP55196 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFDNP55196 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFDNP55196 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFDNP55196 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFDNP55196 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFDNP55196 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
AFDNP55196 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFDNP55196 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFDNP55196 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
AFDNP55196 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFDNP55196 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFDNP55196 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFDNP55196 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFDNP55196 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFDNP55196 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFDNP55196 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFDNP55196 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFDNP55196 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFDNP55196 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
AFDNP55196 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
AFDNP55196 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AFDNP55196 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AFDNP55196 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
AFDNP55196 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
AFDNP55196 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.7 ms