Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD23BP54727 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD23BP54727 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms