Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 RET3YPL010W 570 nt6.95□□□□□ -1.3
SSK2P53599 CAB3YKL088W 1716 nt6.95□□□□□ -1.3
SSK2P53599 DAL7YIR031C 1665 nt6.95□□□□□ -1.3
SSK2P53599 EFT2YDR385W 2529 nt6.94□□□□□ -1.3
SSK2P53599 EFT1YOR133W 2529 nt6.94□□□□□ -1.3
SSK2P53599 YHR182WYHR182W 2358 nt6.94□□□□□ -1.3
SSK2P53599 YGL072CYGL072C 360 nt6.94□□□□□ -1.3
SSK2P53599 PER33YLR064W 822 nt6.94□□□□□ -1.3
SSK2P53599 RSC58YLR033W 1509 nt6.94□□□□□ -1.3
SSK2P53599 IMD2YHR216W 1572 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 SWC3YAL011W 1878 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 OTU1YFL044C 906 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 YLR407WYLR407W 687 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 RNR3YIL066C 2610 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 POP1YNL221C 2628 nt6.93□□□□□ -1.3
SSK2P53599 BZZ1YHR114W 1902 nt6.92□□□□□ -1.3
SSK2P53599 YDR445CYDR445C 408 nt6.92□□□□□ -1.3
SSK2P53599 FBP1YLR377C 1047 nt6.92□□□□□ -1.3
SSK2P53599 VPS68YOL129W 555 nt6.92□□□□□ -1.3
SSK2P53599 TAF5YBR198C 2397 nt6.92□□□□□ -1.3
SSK2P53599 STE7YDL159W 1548 nt6.92□□□□□ -1.3
SSK2P53599 LDB19YOR322C 2457 nt6.91□□□□□ -1.3
SSK2P53599 FUR1YHR128W 651 nt6.91□□□□□ -1.3
SSK2P53599 EFB1YAL003W 621 nt6.91□□□□□ -1.3
SSK2P53599 CSR1YLR380W 1227 nt6.91□□□□□ -1.3
SSK2P53599 FLO8YER109C 2400 nt6.91□□□□□ -1.3
SSK2P53599 MKK2YPL140C 1521 nt6.91□□□□□ -1.3
SSK2P53599 TDA1YMR291W 1761 nt6.91□□□□□ -1.3
SSK2P53599 CWC2YDL209C 1020 nt6.91□□□□□ -1.3
SSK2P53599 DAN1YJR150C 897 nt6.91□□□□□ -1.3
SSK2P53599 MBR1YKL093W 1020 nt6.91□□□□□ -1.3
SSK2P53599 RPS14AYCR031C 414 nt6.9□□□□□ -1.31
SSK2P53599 OCA4YCR095C 1089 nt6.9□□□□□ -1.31
SSK2P53599 NAT2YGR147C 867 nt6.9□□□□□ -1.31
SSK2P53599 ASF2YDL197C 1578 nt6.89□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt6.89□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt6.88□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YER187WYER187W 426 nt6.88□□□□□ -1.31
SSK2P53599 AUA1YFL010W-A 285 nt6.88□□□□□ -1.31
SSK2P53599 CYM1YDR430C 2970 nt6.88□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YER190C-BYER190C-B 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YFL068WYFL068W 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YML133W-BYML133W-B 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 MAL11YGR289C 1851 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 NMD5YJR132W 3147 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 SEA4YBL104C 3117 nt6.87□□□□□ -1.31
SSK2P53599 SEC39YLR440C 2130 nt6.86□□□□□ -1.31
SSK2P53599 KIN4YOR233W 2403 nt6.86□□□□□ -1.31
SSK2P53599 DPH1YIL103W 1278 nt6.86□□□□□ -1.31
SSK2P53599 FLD1YLR404W 858 nt6.86□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YTA12YMR089C 2478 nt6.86□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YJR038CYJR038C 363 nt6.85□□□□□ -1.31
SSK2P53599 AIM26YKL037W 357 nt6.85□□□□□ -1.31
SSK2P53599 VAS1YGR094W 3315 nt6.85□□□□□ -1.31
SSK2P53599 YML116W-AYML116W-A 303 nt6.84□□□□□ -1.31
SSK2P53599 LTV1YKL143W 1392 nt6.84□□□□□ -1.31
SSK2P53599 CEX1YOR112W 2286 nt6.83□□□□□ -1.32
SSK2P53599 LOH1YJL038C 660 nt6.83□□□□□ -1.32
SSK2P53599 YER158CYER158C 1722 nt6.82□□□□□ -1.32
SSK2P53599 HMX1YLR205C 954 nt6.81□□□□□ -1.32
SSK2P53599 YHR173CYHR173C 339 nt6.8□□□□□ -1.32
SSK2P53599 YML031C-AYML031C-A 336 nt6.8□□□□□ -1.32
SSK2P53599 UBX2YML013W 1755 nt6.8□□□□□ -1.32
SSK2P53599 GDA1YEL042W 1557 nt6.8□□□□□ -1.32
SSK2P53599 SMC5YOL034W 3282 nt6.79□□□□□ -1.32
SSK2P53599 GDB1YPR184W 4611 nt6.79□□□□□ -1.32
SSK2P53599 HSP30YCR021C 999 nt6.78□□□□□ -1.32
SSK2P53599 YIL152WYIL152W 708 nt6.78□□□□□ -1.32
SSK2P53599 YJL193WYJL193W 1209 nt6.78□□□□□ -1.32
SSK2P53599 RPL18BYNL301C 561 nt6.78□□□□□ -1.32
SSK2P53599 PXA1YPL147W 2613 nt6.78□□□□□ -1.32
SSK2P53599 YDR090CYDR090C 933 nt6.78□□□□□ -1.32
SSK2P53599 BUD17YNR027W 954 nt6.78□□□□□ -1.32
SSK2P53599 VPS69YPR087W 321 nt6.78□□□□□ -1.32
SSK2P53599 SUM1YDR310C 3189 nt6.77□□□□□ -1.33
SSK2P53599 YGL214WYGL214W 486 nt6.77□□□□□ -1.33
SSK2P53599 BUB3YOR026W 1026 nt6.77□□□□□ -1.33
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